Небольшое редактирование на примере, представленном в http://matplotlib.org/users/shell.html :
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111)
ax.set_title('click on points')
line, = ax.plot(np.random.rand(100), '-', picker=5) # 5 points tolerance
def onpick(event):
thisline = event.artist
xdata = thisline.get_xdata()
ydata = thisline.get_ydata()
ind = event.ind
print 'onpick points:', zip(xdata[ind], ydata[ind])
fig.canvas.mpl_connect('pick_event', onpick)
plt.show()
Это график прямой линии, так как Сохаиб спрашивал