Я нашел самый чистый способ сделать это (особенно в Windows), добавив следующее в C: \ Python26 \ Lib \ site-packages \ sitecustomize.py:
import warnings
warnings.filterwarnings("ignore", category=DeprecationWarning)
Обратите внимание, что я должен был создать этот файл. Конечно, измените путь к python, если ваш отличается.