Генерация DDL для JPA 2.0 с EclipseLink

И:

копии назначены 6, но изменение не возвращается.

вам нужна ссылка или указатель, если вы хотите изменить значение:

попробуйте использовать сигнатуру метода, например:

void changeValue(int& value)

, которая, вероятно, сделает то, что вы ожидали