Mongo позволяет вам обновлять вложенные документы, используя соглашение .
. Посмотрите: Обновление вложенных документов в mongodb . Вот еще один вопрос из прошлого о обновлении слияния, например тот, который вы ищете. Я полагаю: атомное обновление MongoDB через документ 'merge'