Скрыть правильныйBarButtonItem контроллера навигации

Попробуйте

self.navigationItem.rightBarButtonItem = nil;

Когда вы захотите вернуть его обратно, вам придется активировать кнопку, т.е.

UIBarButtonItem *rightBarButton = 
 [[UIBarButtonItem alloc] initWithBarButtonSystemItem:UIBarButtonSystemItemSearch
                                               target:self
                                               action:@selector(searchBar:)];
self.navigationItem.rightBarButtonItem = rightBarButton;
[rightBarButton release];