Удалите первичный ключ таблицы, если он существует:
ALTER TABLE `tableName` DROP PRIMARY KEY;
Добавление столбца автоматического увеличения в таблицу:
ALTER TABLE `tableName` ADD `Column_name` INT PRIMARY KEY AUTO_INCREMENT;
Измените нужный столбец рассматривать как первичный ключ:
alter table `tableName` modify column `Column_name` INT NOT NULL AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY;