Как работает htaccess рекурсия?

Другие ответы работают, но хорошо знать, что сгенерированный JSON будет иметь следующую форму (в этом примере я использую гипотетическое поле «name» для ваших клиентов):

{
    "5587d2c3cd8348455b26feab": {
        "_id": {
            "$id": "5587d2c3cd8348455b26feab"
        },
        "name": "Robert"
    },
    "5587d2c3cd8348455b26feac": {
        "_id": {
            "$id": "5587d2c3cd8348455b26feac"
        },
        "name": "John"
    }
}

So в случае, если вы не хотите, чтобы Object _id был ключом каждого из ваших объектов результата, вы можете добавить параметр false в iterator_to_array. Ваш код будет выглядеть следующим образом:

echo json_encode(iterator_to_array($customers, false), true);

Это создает тот же результат, что и

$result = Array();
foreach ($customers as $entry) {
    array_push($result, $entry);
}
echo json_encode($result, true);

, который является массивом объектов JSON

[
    {
        "_id": {
            "$id": "5587d2c3cd8348455b26feab"
        },
        "name": "Robert"
    },
    {
        "_id": {
            "$id": "5587d2c3cd8348455b26feac"
        },
        "name": "John"
    }
]