Если вы говорите о средах тестирования / dev, просто используйте опцию debug. Он будет автоматически перезагружать флеш-приложение, когда произойдет смена кода.
app.run(debug=True)
Или, из оболочки:
$ export FLASK_DEBUG=1
$ flask run
http: //flask.pocoo .org / Docs / Быстрый старт / # отладочный режим