8
ответов

Преобразование FASTQ к FASTA с SED/AWK

У меня есть данные в том, всегда прибывает в блок четыре в следующем формате (названный FASTQ): @SRR018006.2016 GA2:6:1:20:650 length=36 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGN +SRR018006.2016 GA2:6:1:20:...
вопрос задан: 12 December 2018 11:29
1
ответ

Для цикла: обрабатывать файлы в разных папках UNIX

Я пытался найти ответ на свой вопрос, просматривая похожие темы, но безуспешно. Может быть, я упустил из виду. Любая помощь приветствуется! Итак, у меня есть сотни папок в моем текущем каталоге ...
вопрос задан: 15 January 2019 20:14
0
ответов

более быстрое тестирование членства в python, чем set ()

Мне нужно проверить наличие миллионов элементов (20 -30 букв str) в списке, содержащем 10-100 тыс. Таких элементов. Есть ли более быстрый способ сделать это в python, чем set ()? import sys #load ids ...
вопрос задан: 20 March 2015 19:46
0
ответов

bash: / bin / ls: слишком длинный список аргументов

Мне нужно составить список из большого количества файлов (40 000 файлов), как показано ниже: ERR001268_1_100.fastq ERR001268_2_156.fastq ERR001753_2_78.fastq ERR001268_1_101.fastq ERR001268_2_157.fastq ...
вопрос задан: 20 March 2015 15:39