Вопросы Теги

Установка rgdal на ubuntu 16.04 [duplicate]

Лучшим способом (рекомендуется) является использование пакета java.util.Concurrent. Используя этот пакет, вы можете легко избежать этого исключения. см. Модифицированный код 

public static void main(String[] args) {
        Collection<Integer> l = new CopyOnWriteArrayList<Integer>();

        for (int i=0; i < 10; ++i) {
            l.add(new Integer(4));
            l.add(new Integer(5));
            l.add(new Integer(6));
        }

        for (Integer i : l) {
            if (i.intValue() == 5) {
                l.remove(i);
            }
        }

        System.out.println(l);
    }
90
задан juba 6 March 2013 в 15:39
поделиться

11 ответов

Если вы посмотрите на страницу пакета на CRAN , вы увидите следующее:

SystemRequirements: для построения из источника: GDAL> = 1.7.1 библиотека из http://trac.osgeo.org/gdal/wiki/DownloadSource и PROJ.4 (proj> = 4.4.9) из http://trac.osgeo.org/ Рго / [/ д2]; Основы GDAL OSX, созданные Уильямом Кингсбери в http://www.kyngchaos.com/ , могут использоваться для установки источника в OSX.

Как вам кажется под Linux вы всегда создаете пакет из исходного кода, поэтому вам нужно будет установить соответствующие библиотеки в вашей системе. Если вы находитесь под Монетным двором, Ubuntu или другим производным Debian, вы можете сделать: 

$ sudo apt-get install libgdal1-dev libproj-dev

. Один совет, который может быть полезен, все еще находящийся в системе на базе Debian, заключается в установке пакета apt-file и запуске : 

$ sudo apt-file update

Затем, когда вы получите сообщение об ошибке, например: 

configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.

Вы можете использовать следующую команду, чтобы определить, какой пакет вы должны установить, чтобы получить отсутствующий файл: 

$ apt-file search proj_api.h
libproj-dev: /usr/include/proj_api.h
118
ответ дан tflutre 18 August 2018 в 13:37
поделиться
  • 1
    Не совсем для меня работала, работая под управлением Linux Mint 17.1. Ребекка построила надежную версию Ubuntu 14.04 - apt-file не работала. Я закончил удаление libproj-dev и повторно установил его из-за некоторой проблемы с коррупцией & amp; затем установите libgdal1, libgdal1-dev и зависимости (версия 1.11.2 в официальном репозитории на момент написания этой статьи, но я видел version 2 здесь, так что изменение может быть на горизонте) – MichaelChirico 2 September 2015 в 22:43

Для людей в многопользовательских средах с несколькими версиями proj, установленными (из источника), метод, который я использовал, был: 

install.packages('rgdal',configure.args="--with-proj-include=/sw/proj/4.9.2/include --with-proj-lib=/sw/proj/4.9.2/lib")
1
ответ дан Abhinav Singh Maurya 18 August 2018 в 13:37
поделиться

Для пользователей Mac (OS.X Version10.12.6), это сработало для меня. Сначала перейдите в командную строку и установите gdal , используя >> brew install gdal. Во-вторых, добрались до Rstuduio (консоль R) и установили пакет с помощью install.packages("rgdal")

1
ответ дан ewalel 18 August 2018 в 13:37
поделиться

Вот что я сделал в Centos7: 

yum install gdal gdal-devel
yum install proj
yum install proj-nad
yum install proj-epsg

Тогда просто

install.packages("rgdal")

Работал отлично, но это было не совсем понятно.

10
ответ дан Jacques Peeters 18 August 2018 в 13:37
поделиться
  • 1
    Я просто тестировал в новом Centos 7, я думаю, вам нужно proj-devel, а не только proj. В противном случае мы получаем configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations. Это для rgdal 1.2-6. – HenrikB 22 April 2017 в 03:51
  • 2
    Мне нужна версия & gt; 2.0 для использования пакета sf. Эти инструкции работали для меня, хотя они занимали много времени, терпели. [Д0] gis.stackexchange.com/questions/263495/… – Elin 30 June 2018 в 13:08

В системе Fedora 21, использующей R-3.2.0, работало: 

yum install gdal.x86_64 gdal-devel.x86_64 gdal-libs.x86_64
yum install proj.x86_64 proj-devel.x86_64
yum install proj-epsg.x86_64 proj-nad.x86_64

. Очевидно, это было результатом повторных попыток получить: 

install.packages("rgdal")

работать. Возможно, вы можете сделать все это в одной установке.

22
ответ дан jimlemon 18 August 2018 в 13:37
поделиться

Для меня (Ubuntu 16.04, R 3.4.2) была использована смесь из вышеперечисленных решений: 

sudo apt-get install libudunits2-dev libgdal-dev libgeos-dev libproj-dev

Затем просто установили rgdal из CRAN.

0
ответ дан jogall 18 August 2018 в 13:37
поделиться

Если вы используете OS X с менеджером пакетов Homebrew и имеете R, установленный через homebrew-science tap , вы можете установить rgdal, предварительно установив gdal. 

brew install gdal

Сначала вы можете указать параметры, доступные перед запуском, если вы хотите что-то fancy , как поддержка postgresql. Чтобы увидеть доступные типы параметров 

brew options gdal

, то, чтобы быть фантастическим, вы можете набрать 

brew install --with-postgresql gdal

через некоторое время, когда вам будет хорошо идти с зависимостями, так как proj включая ваши необходимые proj_api.h - зависимости! К сожалению, rgdal до сих пор не находит pro_api.h прямо сейчас, поскольку он не ищет / usr / local / include. Чтобы исправить эту и другие возможные недуги с помощью вашей установки rgdal, используйте следующую команду R для установки rgdal: 

  > install.packages('rgdal', type = "source", configure.args=c('--with-proj-include=/usr/local/include','--with-proj-lib=/usr/local/lib'))

Это должно быть похоже на то, что вам также понадобится для MacPorts , за исключением шагов варки, а ваши библиотеки / заголовки наиболее вероятны в разделе «/ opt / local / lib» и «/ opt / local / include» соответственно.

Примечание: чтобы заваривать обновления , если вы используете «-with-armadillo» в качестве опции с gdal и обновили armadillo до 7 с 6. Вам придется перекомпилировать gdal перед обновлением / переустановкой rgdal.

30
ответ дан Jonathan Lisic 18 August 2018 в 13:37
поделиться
  • 1
    Благодарю. ваш метод работает на моей машине после нескольких сбоев в соответствии с другим опубликованным решением. – HappyCoding 21 October 2015 в 08:58
  • 2
    Бог послал решение! Я не знаю, сколько часов я потратил на это. Eeesh – josiekre 25 February 2016 в 00:15
  • 3
    Работал для меня. Осталось только перезагрузить R после установки пакета rgdal. – smacdonald 26 April 2017 в 04:37

Единственное, что работало в моей системе, - это скомпилировать PROJ4 из источника, как описано здесь здесь , а затем установить пакет rgdal как 

 install.packages("rgdal")
1
ответ дан mace 18 August 2018 в 13:37
поделиться

В OSX я загружаю proj из http://www.kyngchaos.com/software/frameworks , и я запускаю следующую команду в R. 

install.packages('rgdal', type = "source", configure.args=c('--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers', '--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'))
4
ответ дан matiskay 18 August 2018 в 13:37
поделиться

Это сработало для меня: 

install.packages('rgdal',repos="http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin")
4
ответ дан RoyalTS 18 August 2018 в 13:37
поделиться
  • 1
    Это единственное, что сработало для меня во всех поисках, которые я сделал. – podcastfan88 22 December 2014 в 23:05
  • 2
    это не работает для меня (для версии R.2.2.2) – HappyCoding 21 October 2015 в 08:33

На ubuntustudio 14.04 (тот же для всех debian distros): 

sudo apt-get install libproj-dev libgdal-dev

Тогда я мог установить пакет rgdal 

R info:
R version 3.0.2 (2013-09-25) -- "Frisbee Sailing"

Linux info:
Linux francois-K53SV 3.13.0-34-lowlatency #60-Ubuntu SMP PREEMPT Wed Aug 13 16:15:18 UTC 2014 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
9
ответ дан ugo 18 August 2018 в 13:37
поделиться
Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: