Как преобразовать нулевой байтовый массив в строку?

Если вы знаете, сколько целых чисел вы получите, то вы можете использовать метод nextInt()

Например

Scanner sc = new Scanner(System.in);
int[] integers = new int[3];
for(int i = 0; i < 3; i++)
{
    integers[i] = sc.nextInt();
}