что это за пункт с маркером

не отображается с кругами?

Это сработало для меня. Неоднократно вызывает функцию, обновляющую график каждый раз.

import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.animation as anim

def plot_cont(fun, xmax):
    y = []
    fig = plt.figure()
    ax = fig.add_subplot(1,1,1)

    def update(i):
        yi = fun()
        y.append(yi)
        x = range(len(y))
        ax.clear()
        ax.plot(x, y)
        print i, ': ', yi

    a = anim.FuncAnimation(fig, update, frames=xmax, repeat=False)
    plt.show()

«fun» - это функция, которая возвращает целое число. FuncAnimation будет многократно называть «обновление», он будет делать это «xmax» раз.