JPA несколько менеджеров транзакций

Я предполагаю, что у Вас есть 2 варианта

Если Ваши примеры использования никогда не требуют обновлений обеих баз данных в рамках той же транзакции, то можно ли использовать два JpaTransactionManagers, но я не уверен, что Вы сможете использовать подход @Transactional? В этом случае Вам было бы нужно к нейтрализации на более старом механизме использования простого TransactionProxyFactoryBean для определения границ транзакции, например:

<bean id="firstRealService" class="com.acme.FirstServiceImpl"/>
<bean id="firstService"  
    class="org.springframework.transaction.interceptor.TransactionProxyFactoryBean">
    <property name="transactionManager" ref="firstJpaTm"/>
    <property name="target" ref="firstRealService"/>
    <property name="transactionAttributes">
        <props>
           <prop key="insert*">PROPAGATION_REQUIRED</prop>
           <prop key="update*">PROPAGATION_REQUIRED</prop>
           <prop key="*">PROPAGATION_REQUIRED,readOnly</prop>
        </props>
    </property>
</bean>
<!-- similar for your second service -->

Если Вы, требуют транзакции, охватывающей обе базы данных, то необходимо будет использовать менеджер транзакций JTA. Состояния API:

Этот менеджер транзакций подходит для приложений, которые используют единственный JPA EntityManagerFactory для доступа данных транзакций. JTA (обычно через JtaTransactionManager) необходим для доступа к нескольким транзакционным ресурсам в рамках той же транзакции. Обратите внимание, что необходимо настроить поставщика JPA соответственно, чтобы заставить его участвовать в транзакциях JTA.

То, что это означает, - то, что необходимо будет предоставить менеджер транзакций JTA. В нашем приложении мы используем конфигурацию, подобную следующему:

<tx:annotation-driven transaction-manager="txManager"/>

<bean id="txManager" 
    class="org.springframework.transaction.jta.JtaTransactionManager">
    <property name="transactionManagerName" value="appserver/jndi/path" />
</bean>

Если Вы развертываетесь в appserver, то пружинный JtaTransactionManager должен сделать поиск к реальному менеджеру транзакций XA-compliant JTA, предоставленному appserver. Однако можно также использовать автономный менеджер транзакций JTA (но я еще не попробовал это сам),

Что касается конфигурирования поставщика решения для хранения данных Jpa, я не настолько знаком. Какого поставщика решения для хранения данных JPA Вы используете?

Код выше основан на нашем подходе, где мы использовали собственный компонент, в спящем режиме в противоположность реализации Hibernate JPA. В этом случае мы смогли избавиться от двух бобов HibernateTransactionManager и просто гарантировать, что и SessionFactories были введены с тем же ТМ JTA и затем используют tx:annotation-управляемый элемент.

Надеюсь, это поможет