JDesktopPane с возможностью прокрутки?

Вы можете преобразовать изображение из представления base64 в его двоичное представление, преобразовав строку в Buffer - new Buffer(b64_image, 'base64') (подробнее об этом в этого ответа ). Затем вы можете сохранить буфер в локальной файловой системе, используя fs.writeFile (на случай, если вы хотите сохранить файл асинхронно) или fs.writeFileSync (на случай, если хотел сохранить файл синхронно).

То, что вы пытаетесь сделать, может быть выполнено примерно так:

const fs = require("fs");

const base64Image = "BASE_64_IMAGE";
const imageBuffer = new Buffer(base64Image, "base64");

fs.writeFileSync("image.png", imageBuffer);