Как дела расширенный поиск и замена во всех файлах в проекте Delphi 2006 года

Вы используете системную зону по умолчанию для кода java.time и зону Европа / Берлин для кода Calendar. 7200 - это, скорее всего, разница между системным часовым поясом и Европой / Берлином (2 часа).

Замените все ZoneId.systemDefault() на ZoneId.of("Europe/Berlin"), и вы получите одинаковые значения в обеих версиях:

timestamp = 1536933600
dayStartTimeStamp = 1536876000
dayEndTimeStamp = 1536962399