Как установить границы оси x во всех графах при использовании facet_wrap для данных phyloseq? [Дубликат]
Компилятор хочет, чтобы вы это записывали:
private static List<String> list = new ArrayList<String>();
, потому что в противном случае вы могли бы добавить любой тип, который вам нравится, в list, делая создание как new ArrayList<String>() бессмысленным. Java generics - это только функция времени компиляции, поэтому объект, созданный с помощью new ArrayList<String>(), с радостью примет Integer или JFrame элементы, если они назначены ссылке «raw type» List - сам объект ничего не знает о какие типы он должен содержать, только компилятор делает.
5 ответов
Это должно значительно упростить вещи:
library('ggthemes')
ggplot(mtcars, aes(mpg, hp)) + geom_point() + facet_wrap(~carb, scales='free') +
theme_tufte() + theme(axis.line=element_line()) +
scale_x_continuous(limits=c(10,35)) + scale_y_continuous(limits=c(0,400))
[/g0]
Пакет lemon добавляет эту функциональность; см. эту виньетку . (Пример кода и график оттуда).
library(lemon)
p + facet_rep_grid(drv ~ cyl) + coord_capped_cart(bottom='both', left='both') +
theme_bw() + theme(panel.border=element_blank(), axis.line=element_line())
Вот длинный обходной путь.
Сначала сохраните исходный сюжет как объект, а затем создайте другой график, который не имеет тиков оси и текстов осей.
p1<-ggplot(mtcars, aes(mpg, hp)) +
geom_point() +
facet_wrap(~carb) +
theme(panel.grid = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
panel.border = element_blank(),
axis.line = element_line(),
strip.background = element_blank(),
panel.margin = unit(2, "lines"))
p2<-ggplot(mtcars, aes(mpg, hp)) +
geom_point() +
facet_wrap(~carb) +
theme(panel.grid = element_blank(),
panel.background = element_blank(),
panel.border = element_blank(),
axis.line = element_line(),
strip.background = element_blank(),
panel.margin = unit(2, "lines"),
axis.ticks=element_blank(),
axis.text=element_blank())
Теперь используйте функцию ggplotGrob(), чтобы преобразовать обе графики в grobs. Если мы посмотрим на структуру этих гномов, вы увидите, что видимая ось y - это grob 14 и 17 (другие - нулевые grobs), а ось x - грыбы 23-25.
g1<-ggplotGrob(p1)
g2<-ggplotGrob(p2)
g2
TableGrob (12 x 12) "layout": 28 grobs
z cells name grob
1 0 ( 1-12, 1-12) background rect[plot.background.rect.3481]
2 1 ( 4- 4, 4- 4) panel-1 gTree[panel-1.gTree.3356]
3 2 ( 4- 4, 7- 7) panel-2 gTree[panel-2.gTree.3366]
4 3 ( 4- 4,10-10) panel-3 gTree[panel-3.gTree.3376]
5 4 ( 8- 8, 4- 4) panel-4 gTree[panel-4.gTree.3386]
6 5 ( 8- 8, 7- 7) panel-5 gTree[panel-5.gTree.3396]
7 6 ( 8- 8,10-10) panel-6 gTree[panel-6.gTree.3406]
8 7 ( 3- 3, 4- 4) strip_t-1 absoluteGrob[strip.absoluteGrob.3448]
9 8 ( 3- 3, 7- 7) strip_t-2 absoluteGrob[strip.absoluteGrob.3453]
10 9 ( 3- 3,10-10) strip_t-3 absoluteGrob[strip.absoluteGrob.3458]
11 10 ( 7- 7, 4- 4) strip_t-4 absoluteGrob[strip.absoluteGrob.3463]
12 11 ( 7- 7, 7- 7) strip_t-5 absoluteGrob[strip.absoluteGrob.3468]
13 12 ( 7- 7,10-10) strip_t-6 absoluteGrob[strip.absoluteGrob.3473]
14 13 ( 4- 4, 3- 3) axis_l-1 absoluteGrob[axis-l-1.absoluteGrob.3433]
15 14 ( 4- 4, 6- 6) axis_l-2 zeroGrob[axis-l-2.zeroGrob.3434]
16 15 ( 4- 4, 9- 9) axis_l-3 zeroGrob[axis-l-3.zeroGrob.3435]
17 16 ( 8- 8, 3- 3) axis_l-4 absoluteGrob[axis-l-4.absoluteGrob.3441]
18 17 ( 8- 8, 6- 6) axis_l-5 zeroGrob[axis-l-5.zeroGrob.3442]
19 18 ( 8- 8, 9- 9) axis_l-6 zeroGrob[axis-l-6.zeroGrob.3443]
20 19 ( 5- 5, 4- 4) axis_b-1 zeroGrob[axis-b-1.zeroGrob.3407]
21 20 ( 5- 5, 7- 7) axis_b-2 zeroGrob[axis-b-2.zeroGrob.3408]
22 21 ( 5- 5,10-10) axis_b-3 zeroGrob[axis-b-3.zeroGrob.3409]
23 22 ( 9- 9, 4- 4) axis_b-4 absoluteGrob[axis-b-4.absoluteGrob.3415]
24 23 ( 9- 9, 7- 7) axis_b-5 absoluteGrob[axis-b-5.absoluteGrob.3421]
25 24 ( 9- 9,10-10) axis_b-6 absoluteGrob[axis-b-6.absoluteGrob.3427]
26 25 (11-11, 4-10) xlab text[axis.title.x.text.3475]
27 26 ( 4- 8, 2- 2) ylab text[axis.title.y.text.3477]
28 27 ( 2- 2, 4-10) title text[plot.title.text.3479]
Итак, используйте соответствующие грыбы участка 2, чтобы заменить нулевые грызуны на участке 1, и вы получите оси.
g1[[1]][[15]]<-g2[[1]][[14]]
g1[[1]][[16]]<-g2[[1]][[14]]
g1[[1]][[18]]<-g2[[1]][[14]]
g1[[1]][[19]]<-g2[[1]][[14]]
g1[[1]][[20]]<-g2[[1]][[23]]
g1[[1]][[21]]<-g2[[1]][[23]]
g1[[1]][[22]]<-g2[[1]][[23]]
grid.draw(g1)
[/g0]
-
1почему бы просто не добавить сегменты к каждой панели с возможностью использования? – baptiste 1 March 2014 в 18:46
-
2@baptiste Потому что я не знаю, как это сделать. Вы можете это показать. – Didzis Elferts 1 March 2014 в 18:50
-
3Хорошо работает, но я вижу, что крещение предоставило более обобщаемый ответ, который он удалил. +1 – Tyler Rinker 1 March 2014 в 19:10
-
4
После ответа Томаса сверху -
Вам просто нужно установить scales='free' в facet_wrap и установить ограничения в scale_x_continuous и scale_y_continuous
ggplot(mtcars, aes(mpg, hp)) + geom_point() + facet_wrap(~carb, scales='free') +
scale_x_continuous(limits=c(10,35)) + scale_y_continuous(limits=c(0,400))
scales = "free"для меня не очень хорош. +1 – Tyler Rinker 1 March 2014 в 19:10