работа с .git/info/exclude слишком поздно

Чтобы удалить файл, который вы добавили, но не зафиксировали, используйте следующую команду:

git rm --cached file.to.remove

Это удалит файл из индекса, но не коснется файла на диске.

Чтобы удалить файл (или файлы) из самого последнего коммита , используйте указанную выше команду git rm --cached, а затем git commit --amend.