Существует ли подобная крону реализация ScheduledExecutorService в Java?

Ну, может быть, я упускаю что-то большое, но ...

void onOpen()
{
    var selected = comobFileTypes.SelectedItem;

    if ( selected != null ) {
        string ext = "." + selected.ToString();

        var files = Directory.EnumerateFiles(sourceDIR.Text, "*.*", SearchOption.AllDirectories).Where(
                s => s.EndsWith( ext );

        // ...more things...
    }

    return;
}

Ключевым моментом здесь является то, что ComboBox имеет свойство SelectedItem , которое может быть null, если ничего не выбрано, или удерживать выбранный параметр.

Если вы хотите выбрать все расширения, вы можете использовать свойство Items .

void onOpen()
{
    string[] items = new string[ comboFileTypes.Items.Length ];

    foreach(int i = 0; i < items.Length; ++i) {
        items[ i ] = "." + comboFileTypes.Items[ i ].ToString();
    }

    var files = new List<string>();
    var allFiles = Directory.EnumerateFiles( sourceDIR.Text, "*.*", SearchOption.AllDirectories );

    foreach(string ext in items) {
        files.AddRange( allFiles.Where( s => s.EndsWith( ext ) );
    }

    // ...more things... with files...
    return;
}

Надеюсь, это поможет.