Как Вы создаете индексатор файла потока?

Попробуйте с помощью этого цикла выполнить ваше требование

output

Array ([0] => Array ([0] => one [1 ] => sun [2] => jan) [1] => Array ([0] => two [1] => mon [2] => feb) [2] => Array ([0] => three [1] => вт [2] => март))

КОД

<?php 
$arr = array(
        0 => array(
                    0 => 'one',
                    1 => 'two',
                    2 => 'three'
                    ),
        1 => array(
                    0 => 'sun',
                    1 => 'mon',
                    2 => 'tues'
                    ),
        2 => array(
                    0 => 'jan',
                    1 => 'feb',
                    2 => 'march'
                    )
        );
    $newarray = [];
    $length = count($arr[0]); 
    foreach ($arr as $key => $value) {
        for ($i=0; $i < $length; $i++) { 
            $newarray[$i][$key] = $value[$i];

        }
        //break;
    }
    print_r($newarray);