Веб-начинающий Java AMI

Я бы предположил, что записи Jetty в вашем списке dependencies приводят к тому, что классы Jetty попадают в .war и, следовательно, также в путь к классам. Некоторые из этих классов имеют некоторые общие аннотации Servlet API, которые выбирает Tomcat, который пытается инициализировать их во время запуска сервера.