Вы используете (или определяете), нестандартные аннотации, и по какой причине. Как насчет рекурсивных аннотаций?

Во-первых, я не уверен, что вы подразумеваете под рекурсивными аннотациями. Вы имеете в виду аннотации, которые могут содержать ссылки на другие аннотации того же типа? Нечто подобное

@Panel(layout=BorderLayout.class,
    nested={
        @Panel(region=NORTH, layout=FlowLayout.class, ...)
        @Panel(region=SOUTH, layout=FlowLayout.class, ...)
    }
)

(это было бы примером того, где я хотел бы использовать его, если бы это было возможно ...)

Что касается моего использования пользовательских аннотаций (и процессоров): генерация кода.

См. http://code.google.com/p/javadude/wiki/Annotations

Например, свойства JavaBean:

@Bean(
    properties={    
      @Property(name="name"),
      @Property(name="phone", bound=true),
      @Property(name="friend", type=Person.class, kind=PropertyKind.LIST)
    }
)
public class Person extends PersonGen {
    // generated superclass PersonGen will contain getters/setters
    //    field definitions, property change support...
}

или пример добавления

package sample;

import java.util.List;

public interface IFlightAgent {
    List<IFlight> getFlight();
    void reserve(IFlight flight);
}

public interface ICarAgent {
    List<ICar> getCars();
    void reserve(ICar car);
}

public interface IHotelAgent {
    List<IHotel> getHotels();
    void reserve(IHotel hotel);
}

package sample;

import com.javadude.annotation.Bean;
import com.javadude.annotation.Delegate;

@Bean(delegates = {
    @Delegate(type = IHotelAgent.class,
              property = "hotelAgent",
              instantiateAs = HotelAgentImpl.class),
    @Delegate(type = ICarAgent.class,
              property = "carAgent",
              instantiateAs = CarAgentImpl.class),
    @Delegate(type = IFlightAgent.class,
              property = "flightAgent",
              instantiateAs = FlightAgentImpl.class)
    }
)
public class TravelAgent extends TravelAgentGen
    implements IHotelAgent, ICarAgent, IFlightAgent
{
    // generated superclass TravelAgentGen will create instances
    //   of the "instantiateAs" classes and delegate the interface
    //   methods to them
}

См. Недостатки обработки аннотаций в Java? и мой ответ на него для некоторых потенциальных проблем с их использованием.