Как выбрать, в спящем режиме результат запроса как ассоциативный массив списка или hashmap

Другое решение - определить объект данных только для отображения этих результатов и позволить Hibernate создавать их экземпляры на лету. Этому классу просто потребуется соответствующий конструктор.

Пример класса (геттеры и поля опущены)

public class InspectionCount() {
    // fields
    public InspectionCount(int count, int year, int quarter) {
        // initialize instance
    }
    // getters
}

Запрос будет выглядеть

select new InspectionCount(count(i.inspectionId), t.year, t.quarter)
        from Inspection as i
        inner join i.inspectionMission as im inner join im.timeline as t
        group by t.year,t.quarter

В результате вы получите Список из InspectionCount s.