Как делают Вас управление версиями и справляются с несколькими ответвлениями Базы данных?

Просто включите JavaScript для jQuery, прежде чем включать свой собственный JavaScript:

<script src="//ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.6.4/jquery.min.js"></script>
<script src="path/to/your/script.js"></script>

Хотя другие предлагали просто скопировать и вставить jQuery в свой собственный файл JavaScript, действительно лучше включить jQuery отдельно от канонического Источник, как таковой, позволит вам воспользоваться преимуществами кэширования, которое ваш браузер и промежуточные серверы сделали для этого файла.