def fac(n):
res = []
for i in range(1,n+1):
if n%i == 0:
res.append(i)
def prime(n):
return(fac(n) == [1,n])
def prime_list(n):
pri_list = []
for i in range(1,n+1):
if prime(i)
pri_list.append(i)
return(pri_list)
Чтобы отобразить определенные метки в горизонтальной дендрограмме, одним из решений является установка имен строк фрейма данных на новые метки (все метки должны быть уникальными).
require(graphics)
labs = paste("sta_",1:50,sep="") #new labels
USArrests2<-USArrests #new data frame (just to keep original unchanged)
rownames(USArrests2)<-labs #set new row names
hc <- hclust(dist(USArrests2), "ave")
par(mar=c(3,1,1,5))
plot(as.dendrogram(hc),horiz=T)
[/g1]
labs = paste("sta_",1:50,sep="") #new labels
rownames(USArrests)<-labs #set new row names
hc <- hclust(dist(USArrests), "ave")
library(ggplot2)
library(ggdendro)
#convert cluster object to use with ggplot
dendr <- dendro_data(hc, type="rectangle")
#your own labels (now rownames) are supplied in geom_text() and label=label
ggplot() +
geom_segment(data=segment(dendr), aes(x=x, y=y, xend=xend, yend=yend)) +
geom_text(data=label(dendr), aes(x=x, y=y, label=label, hjust=0), size=3) +
coord_flip() + scale_y_reverse(expand=c(0.2, 0)) +
theme(axis.line.y=element_blank(),
axis.ticks.y=element_blank(),
axis.text.y=element_blank(),
axis.title.y=element_blank(),
panel.background=element_rect(fill="white"),
panel.grid=element_blank())
[/g2]
Используя dendrapply
, вы можете настроить свой дендро по своему усмотрению.
[/g0]
colLab <- function(n) {
if(is.leaf(n)) {
a <- attributes(n)
attr(n, "label") <- substr(a$label,1,2) # change the node label
attr(n, "nodePar") <- c(a$nodePar, lab.col = 'red') # change the node color
}
n
}
require(graphics)
hc <- hclust(dist(USArrests), "ave")
clusDendro <- as.dendrogram(hc)
clusDendro <- dendrapply(clusDendro, colLab)
op <- par(mar = par("mar") + c(0,0,0,2))
plot(clusDendro,horiz=T)