Вы не должны инстанцировать объекта в файле NIB. Если Вы устанавливаете Владельца Файла на класс своего объекта и затем связываете вещи в view/window/whatever, до которого, можно установить объект как владелец во времени выполнения путем загрузки файла пера вручную. Тем путем у Вас может быть динамический экземпляр объекта, который все еще ввел зависимости правильно.
Я считаю, что по умолчанию выполняется печать в System.out или System.err. Существует интерфейс ErrorHandler, который вы можете установить в анализаторе, если вы напрямую взаимодействуете с классами Xerces.
В противном случае вы можете попробовать установить свойство org.apache.xerces.impl.Constants.ERROR_REPORTER_PROPERTY в SAXParser с экземпляром из XMLErrorReporter
Я недавно столкнулся с такой же потребностью. Установка ErrorHandler в значение NULL подавляет строку печати Fatal Error.
parser.setErrorHandler(null);