Откройте командную строку администратора и сделайте эту команду:
fsutil fsinfo ntfsinfo [your drive]
Байты На Кластер эквивалент единицы выделения.
Посмотрите, как использовать .gitignore для игнорирования сгенерированных файлов. Возможно, вам также придется выполнить gitrm.