Где R хранит пакеты?
install.packages() функция в R является автоматической утилитой разархивации, которая добирается и пакеты установки в R.
Как я узнаю, какой каталог R принял решение сохранить пакеты?
Как я могу изменить каталог в который хранилища R и пакеты доступов?
3 ответа
Команда install.packages просматривает переменную .libPaths. Вот что у меня по умолчанию на OSX:
> .libPaths()
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Resources/library"
Я не устанавливаю туда пакеты по умолчанию, я предпочитаю, чтобы они были установлены в моем домашнем каталоге. В моем .Rprofile у меня есть такая строка:
.libPaths( "/Users/tex/lib/R" )
Это добавляет каталог «/ Users / tex / lib / R» в начало переменной .libPaths.
Это задокументировано в руководстве «Установка и администрирование R», которое прилагается к вашей установке.
На моем компьютере с Linux:
R> .libPaths()
[1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library"
[3] "/usr/lib/R/library"
R>
означает, что путь по умолчанию - первый из них. Вы можете переопределить это с помощью аргумента для install.packages () (внутри R) или R CMD INSTALL (вне R).
Вы также можете переопределить, установив переменную R_LIBS_USER.
Спасибо за указание от двух вышеупомянутых ответчиков. Предложение Джеймса Томпсона лучше всего сработало для пользователей Windows.
Перейдите туда, где установлена ваша программа R. В литературе он упоминается как
R_Home. Как только вы его найдете, перейдите в подкаталог / etc.C: \ R \ R-2.10.1 \ etcВыберите в этой папке файл с именем Rprofile.site. Открываю с помощью VIM. Вы обнаружите, что это простой файл с менее чем 20 строками кода. Я вставил в код следующее:
# путь к моей пользовательской библиотеке . LibPaths ("C: / R / library")(Комментарий добавлен для отслеживания того, что Я сделал это с файлом.)
В R, набрав функцию
.libPaths (), вы получите первую цель наC: / R / Library
ПРИМЕЧАНИЕ: вероятно, больше, чем один из способов добиться этого, но другие методы, которые я пробовал, по какой-то причине не работали.