Как объединить две ветки с разными иерархиями каталогов в git?

Я начал использовать Maven с проектом веб-приложения, поэтому иерархия каталогов изменилась. Я создал новую ветку для интеграции Maven. Теперь у меня есть две ветки: одна со старой иерархией каталогов, а другая - с иерархией каталогов maven. В обеих ветках есть новые коммиты (исправления и новые функции).

Я хотел бы избавиться от старой ветки и объединить ее изменения с веткой Maven. Git merge порождает бесчисленные конфликты, которые кажется невозможным разрешить. Я считаю, что это происходит потому, что пути к файлам изменились.

Как лучше всего подойти к этому слиянию?