Java Decompiler (JD) обычно рекомендуется как хороший, ну, Java Decompiler. JD-Eclipse - это плагин Eclipse для JD.
У меня были проблемы с запуском плагина на нескольких разных машинах. Когда бы я ни пытался открыть файл .class, стандартный редактор «Источник не найден» показывал, отображение разборки байт-кода низкого уровня, а не исходный код Java, который вы ожидаете от декомпилятора.
Документация по установке в http://java.decompiler.free.fr/?q=jdeclipse неплохая, но довольно расплывчато, когда дело доходит до устранения неполадок.
Открытие этого вопроса для сбора дополнительной информации: С какими проблемами вы столкнулись до того, как JD работал в Eclipse Helios? Какое было решение?