У меня есть функция R, которая производит 95% замещающих знаков уверенности для scatterplots. Вывод похож на это, имея значение по умолчанию 50 точек для каждого эллипса (50 строк):
[,1] [,2]
[1,] 0.097733810 0.044957994
[2,] 0.084433494 0.050337990
[3,] 0.069746783 0.054891438
Я хотел бы наложить много таких замещающих знаков для каждого уровня фактора, названного 'сайтом' на a ggplot2
scatterplot, произведенный из этой команды:
> plat1 <- ggplot(mapping=aes(shape=site, size=geom), shape=factor(site)); plat1 + geom_point(aes(x=PC1.1,y=PC2.1))
Это выполняется на наборе данных, названном dflat
который похож на это:
site geom PC1.1 PC2.1 PC3.1 PC1.2 PC2.2
1 Buhlen 1259.5649 -0.0387975838 -0.022889782 0.01355317 0.008705276 0.02441577
2 Buhlen 653.6607 -0.0009398704 -0.013076251 0.02898955 -0.001345149 0.03133990
Результат прекрасен, но когда я пытаюсь добавить эллипс (скажем, для этого сайта, названного "Buhlen"):
> plat1 + geom_point(aes(x=PC1.1,y=PC2.1)) + geom_path(data=subset(dflat, site="Buhlen"),mapping=aes(x=ELLI(PC1.1,PC2.1)[,1],y=ELLI(PC1.1,PC2.1)[,2]))
Я получаю сообщение об ошибке: "Error in data.frame(x = c(0.0977338099339815, 0.0844334944904515, 0.0697467834016782, : arguments imply differing number of rows: 50, 211
Мне удалось зафиксировать это в прошлом, но я не могу помнить как. Кажется, что geom_path полагается на те же точки вместо того, чтобы вывести новые на печать. Любая справка ценилась бы.