Что бы вы сделали, когда случайно отправили свою ветку функций в удаленный репозиторий?

Нет необходимости создавать пользовательскую строку с помощью GROUP_CONCAT. Вы можете использовать простой IN:

SELECT * 
FROM courses 
WHERE course_id IN (SELECT course_id  
                    FROM university_schools WHERE univ_id = '2289');

Обратите внимание, что с GROUP_CONCAT вы получите что-то вроде:

IN ('1,2,3,4')
--and I guess you expect:
IN (1,2,3,4)