Как Вы отображаете анимированный GIF в JAVA-приложении?
Используя Swing, вы можете просто использовать JLabel
public static void main(String[] args) throws MalformedURLException {
URL url = new URL("<URL to your Animated GIF>");
Icon icon = new ImageIcon(url);
JLabel label = new JLabel(icon);
JFrame f = new JFrame("Animation");
f.getContentPane().add(label);
f.setDefaultCloseOperation(JFrame.EXIT_ON_CLOSE);
f.pack();
f.setLocationRelativeTo(null);
f.setVisible(true);
}