Для новой версии gnuplot попробуйте это:
См. путь к файлу gnuplotrc с помощью команды в gnuplot:
*show loadpath*
Then просто откройте файл и добавьте нужные команды.
Вот подробная информация из документации последней версии (4.6):
Когда gnuplot , он сначала ищет системный файл инициализации с именем gnuplotrc. Местоположение этого файла определяется, когда программа построена и сообщается показывает путь загрузки . Затем программа заглядывает в домашний каталог пользователя для файла под названием .gnuplot в Unix-подобных системах или GNUPLOT.INI для других систем. (Windows и OS / 2 будут искать его в каталоге, указанном в переменной окружения GNUPLOT; Windows будет использовать USERPROFILE, если GNUPLOT не определен). Примечание. Программа может быть сконфигурирована так, чтобы она выглядела первой в текущем каталоге, но это не рекомендуется, потому что это плохая практика безопасности.