Можно ли получить поле, с которым @Convert аннотирует в jpa AttributeConverter?

Вы используете mysql_stmt_num_rows в стиле ООП, поэтому назвать его как функцию неверным. Попробуйте:

$stmt->num_rows;

вместо:

$stmt->num_rows();

В основном вы пытаетесь получить это значение:

class mysqli_stmt { 

   int num_rows

}

Кроме того,

$stmt->store_result;

Должно быть:

$stmt->store_result();