Есть ли способ перепроектировать Java-код?

Если я правильно вас понимаю, space = "free_x" делает то, что вы хотите.

library(ggplot2)

ggplot(mydf, aes(X, Y)) + geom_point()+ 
facet_grid (.~ groups, scales = "free_x", space = "free_x")

[/g0]

И если вам нужен тот же стиль маркировки на оси х:

ggplot(mydf, aes(X, Y)) + geom_point()+ 
 scale_x_continuous(breaks = seq(0,20,2)) +
 facet_grid (.~ groups, scales = "free_x", space = "free_x")

[/g1]