R tm removeWords функция не удаляет слова

Я пытаюсь удалить некоторые слова из корпуса, который я построил, но, похоже, он не работает. Сначала я пробегаю все и создаю фрейм данных, в котором перечислены мои слова в порядке их частоты. Я использую этот список, чтобы найти слова, которые мне не интересны, а затем пытаюсь создать новый список со словами, которые были удалены. Тем не менее, слова остаются в моем наборе данных. Мне интересно, что я делаю неправильно и почему слова не удаляются? Я включил полный код ниже:

install.packages("rvest")
install.packages("tm")
install.packages("SnowballC")
install.packages("stringr")
library(stringr) 
library(tm) 
library(SnowballC) 
library(rvest)

# Pull in the data I have been using. 
paperList <- html("http://journals.plos.org/plosone/search?q=nutrigenomics&sortOrder=RELEVANCE&filterJournals=PLoSONE&resultsPerPage=192")
paperURLs <- paperList %>%
  html_nodes(xpath="//*[@class='search-results-title']/a") %>%
  html_attr("href")
paperURLs <- paste("http://journals.plos.org", paperURLs, sep = "")
paper_html <- sapply(1:length(paperURLs), function(x) html(paperURLs[x]))

paperText <- sapply(1:length(paper_html), function(x) paper_html[[1]] %>%
                      html_nodes(xpath="//*[@class='article-content']") %>%
                      html_text() %>%
                      str_trim(.))
# Create corpus
paperCorp <- Corpus(VectorSource(paperText))
for(j in seq(paperCorp))
{
  paperCorp[[j]] <- gsub(":", " ", paperCorp[[j]])
  paperCorp[[j]] <- gsub("\n", " ", paperCorp[[j]])
  paperCorp[[j]] <- gsub("-", " ", paperCorp[[j]])
}

paperCorp <- tm_map(paperCorp, removePunctuation)
paperCorp <- tm_map(paperCorp, removeNumbers)

paperCorp <- tm_map(paperCorp, removeWords, stopwords("english"))

paperCorp <- tm_map(paperCorp, stemDocument)

paperCorp <- tm_map(paperCorp, stripWhitespace)
paperCorpPTD <- tm_map(paperCorp, PlainTextDocument)

dtm <- DocumentTermMatrix(paperCorpPTD)

termFreq <- colSums(as.matrix(dtm))
head(termFreq)

tf <- data.frame(term = names(termFreq), freq = termFreq)
tf <- tf[order(-tf[,2]),]
head(tf)

# After having identified words I am not interested in
# create new corpus with these words removed.
paperCorp1 <- tm_map(paperCorp, removeWords, c("also", "article", "Article", 
                                              "download", "google", "figure",
                                              "fig", "groups","Google", "however",
                                              "high", "human", "levels",
                                              "larger", "may", "number",
                                              "shown", "study", "studies", "this",
                                              "using", "two", "the", "Scholar",
                                              "pubmedncbi", "PubMedNCBI",
                                              "view", "View", "the", "biol",
                                              "via", "image", "doi", "one", 
                                              "analysis"))

paperCorp1 <- tm_map(paperCorp1, stripWhitespace)
paperCorpPTD1 <- tm_map(paperCorp1, PlainTextDocument)
dtm1 <- DocumentTermMatrix(paperCorpPTD1)
termFreq1 <- colSums(as.matrix(dtm1))
tf1 <- data.frame(term = names(termFreq1), freq = termFreq1)
tf1 <- tf1[order(-tf1[,2]),]
head(tf1, 100)

Если вы посмотрите tf1, вы заметите, что множество слов, которые были указаны для удаления, на самом деле не были удалены.

Просто интересно, что я делаю неправильно и как я могу удалить эти слова из моих данных?

ПРИМЕЧАНИЕ: removeWords что-то делает, потому что выходные данные из head(tm, 100) и head(tm1, 100) не совсем точно тот же самый. Таким образом removeWords, кажется, удаляет некоторые экземпляры слов, от которых я пытаюсь избавиться, но не все случаи.