Обычно я нашел ответ сразу после публикации вопроса. Похоже, JYaml - это то, что мне нужно. В первый раз, когда я увидел этот инструмент, я просто взглянул на YAML4DbUnit и подумал, что это просто расширение DbUnit.
Fixjures: https://code.google.com/archive/p/fixjures/
2.0-rc1 включает поддержку YAML. Библиотека поддерживает POJO и интерфейсные прокси.