Проблема:
b=1; c=0;
a=b/c;
// Error Divide by zero
Решение простое:
if(c!=0) a=b/c;
else // error handling
Я бы использовал readlines и split.
cc = 'CARTESIAN_COORDINATES.txt'
with open(cc) as data:
lines = data.readlines()[2:] # skip first two lines
for line in lines:
ls = line.split()
a, b, c, d, e = int(ls[0]), ls[1], float(ls[2]), float(ls[3]), float(ls[4])
print(a, b, c, d, e)
Вывод:
1 C 0.011987266 -0.003842185 0.006578784
2 H 1.097152909 -0.003956163 0.01333931
3 H -0.349612312 1.019316731 0.001903075
4 H -0.344276148 -0.517463019 -0.880495291
5 H -0.355315644 -0.513266496 0.891567896
Предлагаю вам заглянуть в np.genfromtxt . Следующий фрагмент кода будет читать данные примера из вашего вопроса, хранящиеся в файле с именем data.txt
.
import numpy as np
data = np.genfromtxt('data.txt', skip_header=2, dtype=[('id', 'i8'),('label','S1'),('x','f8'),('y','f8'),('z','f8')])
print(data)
Выход
[(1, b'C', 0.01198727, -0.00384219, 0.00657878)
(2, b'H', 1.09715291, -0.00395616, 0.01333931)
(3, b'H', -0.34961231, 1.01931673, 0.00190307)
(4, b'H', -0.34427615, -0.51746302, -0.88049529)
(5, b'H', -0.35531564, -0.5132665 , 0.8915679 )]
Regex построен для извлечения данных из данных - если ваши таблицы всегда хорошо определены, вы можете извлечь их, используя fe: https://regex101.com/r/QUT2o3/2
[110 ]Применить регулярное выражение:
matches = re.findall(regex, test_str, re.MULTILINE | re.DOTALL)
for m in matches:
print('\n'.join(x.strip() for x in m.splitlines()))
Вывод:
1 C 0.011987266 -0.003842185 0.006578784
2 H 1.097152909 -0.003956163 0.013339310
3 H -0.349612312 1.019316731 0.001903075
4 H -0.344276148 -0.517463019 -0.880495291
5 H -0.355315644 -0.513266496 0.891567896
1 C 0.011987266 -0.003842185 0.006578784
2 H 1.097152909 -0.003956163 0.013339310
3 H -0.349612312 1.019316731 0.001903075
4 H -0.344276148 -0.517463019 -0.880495291
5 H -0.355315644 -0.513266496 0.891567896
1 C 0.011987266 -0.003842185 0.006578784
2 H 1.097152909 -0.003956163 0.013339310
3 H -0.349612312 1.019316731 0.001903075
4 H -0.344276148 -0.517463019 -0.880495291
5 H -0.355315644 -0.513266496 0.891567896