Разобрать DNAstringsSets в нормальные строки

Для многомерных массивов может быть сложно получить доступ к свойству length правого измерения. Возьмем следующий код, например:

int [][][] a  = new int [2][3][4];

for(int i = 0; i < a.length; i++){
    for(int j = 0; j < a[i].length; j++){
        for(int k = 0; k < a[j].length; k++){
            System.out.print(a[i][j][k]);
        }
        System.out.println();
    }
    System.out.println();
}

Каждое измерение имеет разную длину, поэтому тонкая ошибка заключается в том, что средняя и внутренняя петли используют свойство length той же размерности (поскольку a[i].length (f5)).

Вместо этого внутренний цикл должен использовать a[i][j].length (или a[0][0].length для простоты).

-1
задан Ricardo Guerreiro 16 January 2019 в 14:25
поделиться

2 ответа

Вы можете позвонить as.character либо по DNAString, либо по DNAStringSet.

as.character(tempo[1 : 5])
# [1] "G" "T" "A" "T" "T"
0
ответ дан Konrad Rudolph 16 January 2019 в 14:25
поделиться

Простой цикл решает проблему, используя функцию toString той же библиотеки:

ALT <-0
for (i in 1:nrow(vcf)){ ALT[i] <- toString(tempo[[i]]) }

Однако я понятия не имею, почему tempo @ unlistData извлекает слишком много строк. Это не заслуживает доверия.

0
ответ дан Ricardo Guerreiro 16 January 2019 в 14:25
поделиться
Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: