Кафка + описание лидеров и репликации одного из лидеров не существует
У Mongorestore есть эта возможность добавления поверх того, что уже есть в базе данных, поэтому это поведение можно было бы использовать для объединения двух коллекций:
mongodump collection1
collection2 .rename (collection1)
mongorestore
Еще не пробовал, но может работать быстрее, чем подход map / reduce.