Как построить матрицу с выбранными пользователем параметрами? R Shiny

Обычно я делаю общую фильтрацию по строкам следующим образом:

criterion = lambda row: row['countries'] not in countries
not_in = df[df.apply(criterion, axis=1)]
0
задан victorem404 11 February 2019 в 04:27
поделиться

1 ответ

Я сам создал примерный фрейм данных, как вы упомянули выше. Вот модифицированный код.

Изменения, которые я сделал:

  • input$geneExp и input$patients уже являются реактивными, поэтому нет необходимости использовать отдельную реактивную функцию.

  • Отфильтрованные кадры данных для построения графиков используют те же

  • Кроме того, в selectInput установлено значение по умолчанию selected, чтобы избежать начального сообщение об ошибке, когда ничего не выбрано

library(shiny)
library(shinythemes)
library(lattice)

anno_genExp_off <- data.frame(`99901` = c(4.3,6.5,6.6),
                              `99902` = c(5.3,7.5,8.6),
                              `99903` = c(6.3,8.5,9.6),
                              row.names = c("SKI","VWA1","TTLL10"))


anno <- as.matrix(anno_genExp_off)

#Define UI
ui <- fluidPage(
  sidebarPanel(
    titlePanel(title = "Gen3 Gene Expression Data"),
    selectInput(inputId = "patients", 
                label = strong("Please choose patient/s to examine"),
                choices = colnames(anno_genExp_off), 
                selected = colnames(anno_genExp_off)[1],
                multiple = TRUE),
    selectInput(inputId = "geneExp",
                label = "Please select gene expressions/s to examine",
                choices = rownames(anno_genExp_off), 
                selected = rownames(anno_genExp_off)[1],
                multiple = TRUE)),
  mainPanel(plotOutput("testPlot"))  
)

server <- function(input, output) {
  #pdata <- reactive(input$patients)
  #gdata <-reactive(input$geneExp)


  output$testPlot <- renderPlot ({
    levelplot(x = as.matrix(anno_genExp_off[which(rownames(anno_genExp_off) %in% input$geneExp) ,input$patients]), 
              col.regions=colorRampPalette(c("red","green","blue")))
  })
}

shiny::shinyApp(ui,server)


enter image description here

0
ответ дан amrrs 11 February 2019 в 04:27
поделиться
Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: