// в setonclicklistener поместите этот код:
EditText et_number=(EditText)findViewById(R.id.id_of_edittext);
String my_number = et_number.getText().toString().trim();
Intent callIntent = new Intent(Intent.ACTION_CALL, Uri.parse(my_number));
startActivity(callIntent);
// даем разрешение для вызова в манифесте:
<uses-permission android:name="android.permission.CALL_PHONE"></uses-permission>