Программно `git checkout .` с dulwich

Имея этот код

from dulwich.objects import Blob, Tree, Commit, parse_timezone
from dulwich.repo import Repo
from time import time

repo = Repo.init("myrepo", mkdir=True)
blob = Blob.from_string("my file content\n")
tree = Tree()
tree.add("spam", 0100644, blob.id)
commit = Commit()
commit.tree = tree.id


author = "Flav <foo@bar.com>"
commit.author = commit.committer = author
commit.commit_time = commit.author_time = int(time())
tz = parse_timezone('+0200')[0]
commit.commit_timezone = commit.author_timezone = tz
commit.encoding = "UTF-8"
commit.message = "initial commit"

o_sto = repo.object_store
o_sto.add_object(blob)
o_sto.add_object(tree)
o_sto.add_object(commit)

repo.refs["HEAD"] = commit.id

, я получаю фиксацию в истории, НО созданный файл ожидает удаления ( git status говорит об этом) .

git checkout. исправляет.

Мой вопрос: как выполнить git checkout. программно с помощью dulwich?