Работа с отсутствующими значениями для расчета корреляций

У меня есть огромная матрица с большим количеством недостающих значений. Я хочу получить корреляцию между переменными.

1 - это решение

cor(na.omit(matrix))

лучше, чем ниже?

cor(matrix, use = "pairwise.complete.obs")

Я уже выбрал только переменные, имеющие более 20% пропущенных значений.

2 , который является лучшим методом, чтобы иметь смысл?