Я работаю с пакетом randomForest
, и хотя он работает хорошо, это может занять много времени. У кого-нибудь есть предложения по ускорению работы? Я использую коробку Windows 7 с двухъядерным чипом AMD.Я знаю, что R не является многопоточным / процессорным, но мне было любопытно, работал ли какой-либо из параллельных пакетов ( rmpi
, snow
, snowfall
и т. Д.) для материала randomForest
. Спасибо.
РЕДАКТИРОВАТЬ:
Я использую RF для некоторых классификационных работ (0 и 1). Данные содержат около 8–12 столбцов переменных, а обучающий набор представляет собой выборку из 10 тыс. Строк, так что это приличный размер, но не сумасшедший. У меня 500 деревьев и mtry 2, 3 или 4.
РЕДАКТИРОВАТЬ 2: Вот некоторые результаты:
> head(t22)
Id Fail CCUse Age S-TFail DR MonInc #OpenLines L-TFail RE M-TFail Dep
1 1 1 0.7661266 45 2 0.80298213 9120 13 0 6 0 2
2 2 0 0.9571510 40 0 0.12187620 2600 4 0 0 0 1
3 3 0 0.6581801 38 1 0.08511338 3042 2 1 0 0 0
4 4 0 0.2338098 30 0 0.03604968 3300 5 0 0 0 0
5 5 0 0.9072394 49 1 0.02492570 63588 7 0 1 0 0
6 6 0 0.2131787 74 0 0.37560697 3500 3 0 1 0 1
> ptm <- proc.time()
>
> RF<- randomForest(t22[,-c(1,2,7,12)],t22$Fail
+ ,sampsize=c(10000),do.trace=F,importance=TRUE,ntree=500,,forest=TRUE)
Warning message:
In randomForest.default(t22[, -c(1, 2, 7, 12)], t22$Fail, sampsize = c(10000), :
The response has five or fewer unique values. Are you sure you want to do regression?
> proc.time() - ptm
user system elapsed
437.30 0.86 450.97
>