Я думаю, что если вы поместите файлы своих действий в другую папку, кроме стандартной. Вам нужно импортировать файл com.example.yourproject.R (это ваш файл проекта R файла NOT Android.R) для ВСЕХ действий с использованием R. Например, в файле MainActivity вставьте эту строку:
import com .example.yourproject.R;