R YaleToolkit: Как изменить размер шрифта тиковых меток на линиях искр?

Я использую эту функцию для быстрого и простого sparklines с R, но я не могу понять, как изменить размер шрифта, чтобы избежать некрасивого перекрытия меток оси y. Вот мой код (воспроизводимый пример см. ниже):

sparklines(gamma.df, sub=c(1:23),outer.margin = unit(c(2, 2, 2, 2, 2), "cm"))

и полученный график:

enter image description here

Кажется, я могу полностью подавить ось y с помощью

sparklines(gamma.df, sub=c(1:23),yaxis=FALSE,outer. margin = unit(c(2, 2, 2, 2, 2), "cm"))

Но на самом деле я хочу просто уменьшить числа на отметках (и добавить серую заливку под линией, но похоже, что мне придется рисовать полигоны на экране, что, вероятно, достаточно сложно, чтобы заслужить отдельный вопрос... и другой пакет).

В документации говорится, что gpar может быть уместен: "Во всех случаях, когда требуется список графических параметров, допустимые имена параметров те же, что и при передаче gpar в соответствующем вызове". Но мне нужна помощь, чтобы разобраться в этом, поскольку ни одна из моих попыток, похоже, ни к чему не привела (то же самое касается cex.axis и axis()). Есть ли здесь эксперты по grid графике R? Ссылки на хорошо документированный совершенно другой подход (ggplot2?), который дает более качественный вывод в стиле sparkline, также приветствуются.

Вот пример данных и кода, который воспроизводит мою проблему:

x <- data.frame(V = rnorm(1000), W = rnorm(1000), X = rnorm(1000), Y = rnorm(1000), Z = rnorm(10))
sparklines(x,outer.margin = unit(c(2, 2, 2, 2), "cm")) 

А вот результирующий пример графика данных с уродливыми перекрывающимися числами на галочках по оси y:

enter image description here

UPDATE: Используя очень полезный plot код от @geek-on-acid и некоторый код с форума Тафте (см. ниже), я придумал альтернативный метод sparkline, который не использует пакет YaleToolkit и выглядит нормально... Вот воспроизводимый пример (на самом деле всего две строки, но аннотированные здесь для моего образования):

     x <- data.frame(V = rnorm(1000), W = rnorm(1000), X = rnorm(1000), Y = rnorm(1000), 
     Z = rnorm(1000)) # get a bit of data

    par(mfrow=c(ncol(x),1), #sets number of rows in space to number of cols in data frame x
    mar=c(1,0,0,0), #sets margin size for the figures
    oma=c(4,5,4,4)) #sets outer margin

    for (i in 1:ncol(x)){ # setup for statement to loops over all elements in a list or vector
        plot(x[,i], #use col data, not rows from data frame x
        col="grey",lwd=0.5, #make the line grey and thin
        axes=F,ylab="",xlab="",main="",type="l"); #suppress axes lines, set as line plot
        axis(2,yaxp=c(min(x[,i]),max(x[,i]),2), # y-axis: only show tickmarks for max and min values of col
        cex.axis=1.1,las=1, # shrink fontsize slightly, make text horizontal for easy reading
        at=c(round(min(x[,i]),3),round(max(x[,i]),3))); #specify where tickmark numbers go and round them to keep it tidy
        axis(2,yaxp=c(min(x[,i]),max(x[,i]),2),col="white",tcl=0,labels=FALSE)  #y-axis: put a 2nd white axis line over the 1st y-axis to make it invisible
        ymin<-min(x[,i]); tmin<-which.min(x[,i]);ymax<-max(x[,i]);tmax<-which.max(x[,i]); # see the code from Jason below for what these do 
        points(x=c(tmin,tmax),y=c(ymin,ymax),pch=19,col=c("red","blue"),cex=1) # add coloured points at max and min
        }
        axis(1,pos=c(-5)) # places horizontal axis at the bottom of it all. 

Вот результирующее изображение, которое в основном является решением моей проблемы. Галочки по оси y пытаются быть элегантными, показывая только максимальное и минимальное значения данных и не имея вертикальной линии. Еще раз спасибо @geek-on-acid за подсказку, как мне получить одну ось x в нижней части.

enter image description here

Наконец, для полноты картины я включил код для sparklines, более близких к стилю Tufte Джейсона Дитерле, который я нашел на форуме Tufte. Они выглядят намного красивее моих, но код делает только один участок за раз. Вот оригинальное сообщение:

#Here is a simple R implementation of sparklines. Running sparkline() will generate a random sparkline; running sparkline(yourdata) will generate a sparkline using the data in yourdata. As an example, here is Google's stock price for the last year.

#R sparklines
sparkline<-function(ydata=rnorm(100,500,50),width=1.5,height=0.5,sigfigs=4) {

# ydata = vector of data to be plotted
# width = width of sparlkline in inches, including text
# height = height of sparkline in inches
# sigfigs = number of significant figures to round min, max, and last values to

    temppar<-par(no.readonly = TRUE) # store default graphics parameters
    par(mai=c(0.10,0.05,0.10,0.05),fin=c(width,height)) # adjust graphics parameters for sparklines
    len<-length(ydata) # determine the length of the data set
    ymin<-min(ydata) # determine the minimum
    tmin<-which.min(ydata) # and its index
    ymax<-max(ydata) # determine the maximum
    tmax<-which.max(ydata) # and its index
    yfin<-signif(ydata[len],sigfigs) #determine most recent data point
    plotrange=c(ymin-0.3*(ymax-ymin),ymax+0.3*(ymax-ymin)) # define plot range to leave enough room for min and max circles and text
    plot(x=1:len,y=ydata,type="l",xlim=c(1,len*1.5),ylim=plotrange,col="gray",lwd=0.5,ann=FALSE,axes=FALSE) # plot sparkline
    points(x=c(tmin,tmax),y=c(ymin,ymax),pch=19,col=c("red","blue"),cex=0.5) # plot min and max points
    text(x=len,y=ymin,labels=signif(ymin,sigfigs),cex=0.5,pos=4,col="red") # show minimum value
    text(x=len,y=ymax,labels=signif(ymax,sigfigs),cex=0.5,pos=4,col="blue") # show maximum value
    text(x=len,y=(ymin+ymax)/2,labels=yfin,cex=0.5,pos=4) # show most recent value
    par(temppar) # restore graphics defaults
}
#-- Jason Dieterle (email), January 28, 2008

и вот как выглядит его вывод (немного увеличенный):

enter image description here

В дополнение к пакету YaleToolkit есть пакет sparkTable, о котором я узнал на stats.stackexchange, но не пробовал. В R-forge есть запись для другого пакета для создания sparklines, но этот пакет, похоже, не был активным или полезным.

16
задан Community 13 April 2017 в 12:44
поделиться