Gradle build JAR ведет себя иначе, чем обычное выполнение из IDE

Для тех, кто использует nginx и имеет белый экран даже для файла с <?php echo 123;. В моем случае у меня не было этой опции для PHP в файле конфигурации nginx:

fastcgi_param SCRIPT_FILENAME $document_root$fastcgi_script_name;

Этот параметр не был в файле fastcgi_params, поэтому PHP не работал и ошибок не было в журналах.