Скопировать версию файла из другой ветки или зафиксировать без перезаписи текущей версии?

Вы можете использовать git cat-file blob, чтобы получить определенную версию файла. Например, вы можете запустить git cat-file blob origin/master:a.txt >/tmp/a.master.txt, чтобы проверить версию a.txt в ревизии origin/master.

Вы также можете указать другие, произвольно сложные выражения ревизии для этого, при условии, что они указывают на BLOB-объект.