"HEAD not found below refs/heads" after I push commit with CR/CRLF changes

У меня есть локальный репозиторий и удаленный "голый" репозиторий. Я внес изменения в свои локальные файлы, и другой парень тоже внес изменения, но он просто прислал мне файлы. Я скопировал их в своё локальное дерево и зафиксировал. При фиксации я получил сообщения о файлах, которые я скопировал

LF будет заменен на CRLF

Я только что зафиксировал все файлы и переместил их в удаленный пустой репозиторий. И когда на удаленном я запускаю

git branch

я получаю следующее сообщение об ошибке

HEAD not found below refs/heads!

Теперь мне кажется, что это из-за этих файлов с CR вместо CRLF.

Есть какие-нибудь предложения? Буду признателен за любую помощь в решении подобных ситуаций/исправлении моего репозитория.